Es la más ampliamente utilizada. Se basa en la rotación de un campo magnético externo que induce a girar un imán introducido en la solución de reacción. El campo magnético es variable a voluntad del operador, lo que da la posibilidad de tener diferentes velocidades de giro en la solución del matraz de reacción. Para tal fin se dispone dentro del matraz una varilla imantada (núcleo magnético) recubierta de teflón, polipropileno o vidrio Pyrex. Generalmente se utiliza la versión de recubrimiento de teflón, material inerte que evita la contaminación de la mezcla de reacción. Estas varillas, denominadas núcleos magnéticos, tienen diferentes medidas y formas con el fin de adaptarse a todas las necesidades de agitación: medida del matraz, tipo de matraz de fondo redondo o plano, diferentes viscosidades de las soluciones... (Fig 3.1) Este tipo de agitación es adecuado para reacciones a pequeña y mediana escala. Pierde su efectividad en volúmenes grandes, generalmente superiores a 1 litro, o mezclas muy viscosas.

Fig 3.1 Varillas                                                                 Fig. 3.2 Agitador