Las cromatografías en columna se desarrollan del mismo modo que las habituales (por gravedad o flash, a temperatura ambiente o con camisa de refrigeración) pero con una columna tipo schlenk (con una llave en su extremo) y recogeremos las fracciones en matraces schlenk. Se debe purgar la columna y la fase estacionaria antes de empaquetarla (Fig 5.32).

Fig 5.32 Cromatografía bajo atmósfera inerte