Biologia de Sistemes Integrativa, Metabolòmica i Càncer

Marta Cascante Serratosa 
martacascante@ub.edu

Investigadora principal de grup de recerca en l’Institut de Biomedicina de la UB (IBUB) i del “Centro de Investigación en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas” (CIBEREHD) i membre de la plataforma IDIBAPS-Hospital Clinic-UB “ Integrated care in Systems Medicine” (INCASYM).

Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular
Facultat de Biologia. Diagonal, 643
 

• Josep Joan Centelles Serra (PDI – Catedràtic d’Universitat)
• Pedro Ramón de Atauri Carulla (PDI – Professor Agregat)
• Silvia Marin Martinez (PDI – Professor Associat 2n tipus)
• Míriam Neus Tarrado Castellarnau (PDI – investigador CIBER)
• Francesc Cabré Vacas (PDI – Professor Associat 2n tipus)
• Claudia Hernández Carro (doctorand)
• Inês do Carmo Viegas Baptista (doctorand)
• Sai Prashanth Santhapuri (doctorand)
• Milo Basellini (doctorand)
• Marco Fariñas Fernández (PAS/doctorand)
• Alba Calvet Pavón (PAS)
• David López Blanco (TFM)
• Raúl Pérez León (TFG)

• Metabolòmica i fluxòmica: Mesura de metabòlits per espectrometria, GC/MS i LC/MS; Anàlisi d’incorporació de ¹³C en diferents metabòlits. Quantificació de fluxos metabòlics intracel·lulars basat en l'ús de traçadors. Construcció de models metabòlics a escala genòmica (GSMM) específics de condició, línia cel·lular o mostra. Programari de quantificació de fluxos metabòlics integrant dades "òmiques" i/o clíniques ("Machine Learning"). Caracterització de adaptacions metabòliques en processos de diferenciació i mort cel·lular, tumorigènesi, transformació, tractament farmacològic i quimio/immuno resistència.
• Teràpia del càncer: Estudi de diferències en la regulació del metabolisme de línies cel·lulars tumorals respecte de no tumorals. Caracterització i inhibició de la reprogramació metabòlica associada a quimio resistència. Disseny de teràpies antitumorals via inhibició de punts clau del metabolisme. Estudi de propietats antitumorals i antioxidants de polifenols bioactius. Identificació de dianes terapèutiques a partir d'estudis de genòmica funcional i metabolòmica. Fenotipat de l'efecte de compostos químics.
• Control i regulació de vies metabòliques i de transducció de senyals: Programari per anàlisi i modelització. Modelització per predir resultats de manipulacions via enginyeria genètica. Anàlisi del disseny i optimització dels senyals reguladors. Desenvolupament i aplicació de l'Anàlisi del Control Metabòlic (MCA) i la Teoria de Sistemes Bioquímics (BST). Estudi de interaccions enzim-enzim i de enllaços biopolímer-enzim.

• Josep Tarragó-Celada, Carles Foguet, Míriam Tarrado-Castellarnau, Silvia Marin, Xavier Hernández-Alias, Jordi Perarnau, Fionnuala Morrish, David Hockenbery, Roger R Gomis, Eytan Ruppin, Mariia Yuneva, Pedro de Atauri, Marta Cascante. Cysteine and Folate Metabolism Are Targetable Vulnerabilities of Metastatic Colorectal Cancer. Cancers (Basel). 2021 Jan 23;13(3):425. doi: 10.3390/cancers13030425.
• Ibrahim H Polat, Míriam Tarrado-Castellarnau, Adrian Benito, Claudia Hernandez-Carro, Josep Centelles, Silvia Marin, Marta Cascante. Glutamine Modulates Expression and Function of Glucose 6-Phosphate Dehydrogenase via NRF2 in Colon Cancer Cells. Antioxidants (Basel). 2021 Aug 25;10(9):1349. doi: 10.3390/antiox10091349.
• Pedro de Atauri, Míriam Tarrado-Castellarnau, Josep Tarragó-Celada, Carles Foguet, Effrosyni Karakitsou, Josep Joan Centelles, Marta Cascante. Integrating systemic and molecular levels to infer key drivers sustaining metabolic adaptations. PLoS Comput Biol. 2021 Jul 23;17(7):e1009234. doi: 10.1371/journal.pcbi.1009234. eCollection 2021 Jul.
• Carles Foguet, Anusha Jayaraman, Silvia Marin, Vitaly A Selivanov, Pablo Moreno, Ramon Messeguer, Pedro de Atauri, Marta Cascante. p13CMFA: Parsimonious 13C metabolic flux analysis. PLoS Comput Biol. 2019 Sep 6;15(9):e1007310. doi: 10.1371/journal.pcbi.1007310. eCollection 2019 Sep.
• Míriam Tarrado-Castellarnau, Pedro de Atauri, Josep Tarragó-Celada, Jordi Perarnau, Mariia Yuneva, Timothy M Thomson, Marta Cascante. De novo MYC addiction as an adaptive response of cancer cells to CDK4/6 inhibition. Mol Syst Biol. 2017 Oct 4;13(10):940. doi: 10.15252/msb.20167321.

• Entitats Col·laboradores