La Secció de Fisiologia Vegetal treballa en línies de recerca basades en l’estudi de: les respostes de les plantes a l’ambient, la fotomorfogènesi vegetal, l’ecofisiologia, la producció, la fotosíntesi, les relacions sòl-planta, el diagnòstic i control de patògens i plagues, l’ecologia del sòl i la restauració del paisatge. Més recentment s'ha començat a treballar també en genòmica vegetal, biologia molecular i biotecnologia vegetal.