Programa que combina la geometria dinàmica, l'àlgebra i el càlcul. Els elements introduits (punts, vectors, polígons, funcions,...) es poden modificar dinàmicament a la pantalla o a línia d'ordres.

Sistema d'àlgebra computacional, per fer manipulació simbòlica de polinomis, matrius, funcions racionals, integració, derivació, maneig de gràfics, expansió en sèries, entre d'altres.

Considerat l'equivalent lliure del MATLAB, és un programa per realitzar càlculs i anàlisis numèrics. Ofereix un intèrpret que permet executar ordres en mode interactiu, permet crear gràfics i extendre el llenguatge amb funcions

Aplicació per l'anàlisi de dades, utilitza una biblioteca científica per les seves rutines matemàtiques i per la generació de gràfiques.

Llenguatge de programació i entorn de desenvolupament per l'obtenció de càlculs i gràfics estadístics. Proporciona una àmplia varietat de tècniques estadístiques i numèriques, extensibles llibreries i una alta capacitat gràfica.

Sistema algebraic computacional que cobreix aspectes matemàtics com l'àlgebra, la combinatòria, els mètodes numèrics i el càlcul.

Software per l'anàlisi numèric amb un llenguatge de programació, basat en el llenguatge MATLAB, per al càlcul científic.

Paquet estadístic que ofereix una interfície gràfica per l'anàlisi estadística de funcions. Permet importar dades i documents, fer taules, gràfics, tests estadístics i compartir documents a través d'una plataforma senzilla i visual.

GRASS suporta informació ràster i vectorial. Inclou eines per l'emmagatzematge, actualització, visualització i anàlisi de dades espacials, així com per la introducció d'estratègies diverses de modelització.

Permet accedir a informació vectorial i raster així com a servidors de mapes. Es desenvolupa en llenguatge de programació Java i té accés a formats vectorials SHP, DXF, entre d'altres, i formats d'imatge com MrSID, GeoTIFF o ECW.

Mitjançant diferents capes, permet visualitzar tot tipus d'informació geogràfica lliure.Està programat amb biblioteques Qt4 i es pot consultar el mapa geogràfic del món en diversos modes.

Permet la visualització, consulta, edició i anàlisi de mapes ràsters (imatges de teledetecció, ortofotos, models digitals del terreny, mapes temàtics convencionals amb estructura ràster, etc) i de mapes vectorials.

És un sistema d'Informació geogràfica de codi lliure. Permet la utilització de formats raster i vectorials a través de les biblioteques GDAL i OGR així com també de la base de dades.

SAGA (Sistema d'Anàlisi Geocientífic Automatitzat) consta d'una interfície de programació (API) per a la implementació de mètodes científics i d'una interfície gràfica d'usuari (GUI) per fer accessibles aquests mètodes.

Editor molecular dissenyat per la química computacional, el modelat molecular, la bioinformàtica i la ciència de materials. És extensible amb eines interactives i permet incorporar plugins.

Programa gràfic i visual utilitzat en els camps de la bioinformàtica i la quimioinformàtica. És un editor avançat i banc actualitzat que ens permet estudiar i dissenyar molècules i cadenes proteiques.

Projecte dedicat a oferir eines Java pel processament de dades biològiques. Ofereix un conjunt de biblioteques per manipular seqüències, estructures de proteïnes, rutines estadístiques, etc.

Programa especialitzat en aplicacions i interfícies de programació d'aplicacions per la quimioinformàtica i la investigació. Ofereix eines per visualitzar i dibuixar molècules i una extensa base de dates.

Software de biologia computacional dissenyat per desenvolupar i reproduir metodologies d'anàlisi genòmic. Construeix blocs per l'anàlisi a partir de pipelines que capturen el mètode, els paràmetres i les dades.

Programa per realitzar mineria de dades i anàlisi predictiu. Les components poden ser manipulades desde programes desenvolupats en Python o a través d'un entorn gràfic.