10-11-2020
El projecte Biogenoma de Catalunya impulsa quatre projectes de l’IRBio per seqüenciar el genoma d’espècies eucariotes
Barcelona 9 de novembre del 2020. El projecte Biogenoma de Catalunya impulsarà quatre projectes de l’Institut de Recerca de la Biodiversitat (IRBio) en el marc de la convocatòria de l’Earth BioGenome Project (EBP), que ha estat impulsada a través de l’Institut d’Estudis Catalans (IEC) juntament amb dues de les seves societats filials, la Societat Catalana de Biologia (SCB) i la Institució Catalana d’Història Natural (ICHN).
L’Earth BioGenome Project és un projecte de projecció internacional per a obtenir la seqüència del genoma de totes les espècies eucariotes de la Terra, una fita científica que serà clau per a revertir o controlar l’impacte de l’activitat humana en la biosfera.
La convocatòria finançarà un total de vuit projectes amb un pressupost màxim de 10.000 € cadascun, que es podran destinar a treball de camp, catalogació, seqüenciació genòmica, acoblament i anotació.
Projectes finançats:
The genome of the Catalan blind scorpion
Miquel Arnedo –IRBio
Miquel Arnedo –IRBio
Departament de Biologia Evolutiva, Ecologia i Ciències Ambientals
FACULTAT DE BIOLOGIA UB
Els escorpins son un llinatge icònic d’artròpodes que, degut al seu verí i pla corporal característic, han fascinat l’ésser humà des de l’antiguitat. L’escorpí cec, Belisarius xambeui, és un endemisme del Pirineu i pre-Pirineu català. Per les seves incertes relacions evolutives, escasses observacions en la natura i morfologia aberrant, se’l considera l’escorpí més rar d’Europa. La seqüenciació del seu genoma no només ens permetrà conèixer millor el seu parentesc evolutiu, si no que ens ajudarà a entendre les bases genètiques dels cavis morfològics i l’evolució dels verins, així com a determinar aspectes rellevants de la seva dinàmica poblacional que son essencials per a la seva conservació.
Fotos: Marc Domenech Podarcis lilfordi's genome
Laura Baldo - IRBio
Departament de Biologia Evolutiva, Ecologia i Ciències Ambientals
FACULTAT DE BIOLOGIA UB UB
Giacomo Tavecchia – CSIC, Institut Mediterrani d’Estudis Avançats (IMEDEA)
La sargantana de les Balears, Podarcis lilfordi, és una espècie endèmica i emblemàtica de les illes Balears. L’espècie comprèn una multitud de poblacions confinades en diversos illots de les costes de Mallorca, Menorca i Cabrera. La gran diversitat en morfologia, pigmentació, ecologia i trets de la història de vida d’aquestes poblacions aïllades fa de l’espècie P. lilfordi un model genòmic excel·lent per a estudis de genètica, demografia i selecció natural. Actualment, l’espècie figura en perill d’extinció per criteris de la Unió Internacional per a la Conservació de la Natura (UICN) , fet que converteix la seqüènciació del genoma en una eina important per la seva conservació.
Fotos: Joan Lluis RieraThe “morruda” (Diplodus puntazzo) genome
Carlos Carreras - IRBio
Departament de Genètica, Microbiologia i Estadística
FACULTAT DE BIOLOGIA UB
(cast: sargo picudo, eng: sharpsnout seabream)
La morruda és un peix demersal comú a la Mediterrània ben conegut pels pescadors i submarinistes de les nostres costes. Té un paper important en els ecosistemes costaners, ja que s’alimenta d’una gran varietat d’organismes tot incloent-hi espècies tòxiques com ara les esponges, els equinoderms o els celenterats. Pel seu ràpid creixement, s’ha perfilat com una potencial espècie d’interès per al sector de l’aqüicultura. A més, pertany al grup polifilètic dels espàrids, un tàxon del quan només s’ha seqüenciat fins ara el genoma d’una única espècie (Sparus aurata). La seqüenciació del genoma de la morruda ens proporcionarà una eina fonamental per a futurs estudis d’aquest habitant de les nostre costes.
Foto: Enrique Ballesteros
Foto: Enrique Ballesteros
The genome of Pyrenean chamomile (Achillea ptarmica subsp. pyrenaica)
Teresa Garnatje - Institut Botànic de Barcelona (IBB, CSIC-Ajuntament de Barcelona)
Joan Vallès - IRBio
Laboratori de Botànica, Departament de Biologia, Sanitat i Medi Ambient
FACULTAT DE FARMÀCIA I CIÈNCIES DE L'ALIMENTACIÓ UB
El grup de recerca EtnoBioFiC de l'Institut Botànic de Barcelona -un centre mixt del CSIC i de l'Ajuntament de Barcelona- i de la Universitat de Barcelona i l’IRBio, liderarà la seqüenciació del genoma de la camamilla de muntanya (Achillea ptarmica subsp.pyrenaica), una espècie emblemàtica del territori i de gran rellevància pels seus usos medicinals, alimentaris i cosmètics.
Foto: Joan Vallès
Reserva:
Genome sequencing of Carpodesmia mediterranea (Sauvageau)
Jordi Rull Lluch - IRBio
Amelia Gómez Garreta - IRBio
Rafael Martín Martín - IRBio
Laboratori de Botànica, Departament de Biologia, Sanitat i Medi Ambient
FACULTAT DE FARMÀCIA I CIÈNCIES DE L’ALIMENTACIÓ UB
S’analitzarà el genoma de Carpodesmia mediterranea (Sauvageau) Orellana & Sansón (= Cystoseira mediterranea Sauvageau), una alga bruna (Fucales, Phaeophyceae) amplament distribuïda a les costes rocoses dels Països Catalans. Aquesta espècie té gran importància ecològica i forma poblacions denses (praderes) superficials (0-0.5 m de fondària) en costes rocoses -poc inclinades i moderadament batudes- en ambients d’aigües netes. Està considerada com una espècie biondicadora de la qualitat de l’aigua marina i actualment està protegida pel Conveni per a la Protecció del Mar Mediterrani i la Biodiversitat (Conveni de Barcelona).
Foto: Jordi Rull
Genome sequencing of Carpodesmia mediterranea (Sauvageau)
Jordi Rull Lluch - IRBio
Amelia Gómez Garreta - IRBio
Rafael Martín Martín - IRBio
Laboratori de Botànica, Departament de Biologia, Sanitat i Medi Ambient
FACULTAT DE FARMÀCIA I CIÈNCIES DE L’ALIMENTACIÓ UB
S’analitzarà el genoma de Carpodesmia mediterranea (Sauvageau) Orellana & Sansón (= Cystoseira mediterranea Sauvageau), una alga bruna (Fucales, Phaeophyceae) amplament distribuïda a les costes rocoses dels Països Catalans. Aquesta espècie té gran importància ecològica i forma poblacions denses (praderes) superficials (0-0.5 m de fondària) en costes rocoses -poc inclinades i moderadament batudes- en ambients d’aigües netes. Està considerada com una espècie biondicadora de la qualitat de l’aigua marina i actualment està protegida pel Conveni per a la Protecció del Mar Mediterrani i la Biodiversitat (Conveni de Barcelona).
Foto: Jordi Rull